Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms