Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fgfr4Q03142 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fgfr4Q03142 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fgfr4Q03142 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fgfr4Q03142 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fgfr4Q03142 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Fgfr4Q03142 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms