Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms