Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GscQ02591 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms