Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms