Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms