Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms