Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms