Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms