Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms