Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms