Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SeleQ00690 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SeleQ00690 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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