Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms