Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms