Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RhodP97348 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RhodP97348 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RhodP97348 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RhodP97348 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RhodP97348 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RhodP97348 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RhodP97348 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RhodP97348 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RhodP97348 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RhodP97348 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RhodP97348 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RhodP97348 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RhodP97348 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
RhodP97348 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RhodP97348 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms