Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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