Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad1P70340 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad1P70340 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smad1P70340 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad1P70340 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad1P70340 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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