Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Hoxd13P70217 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Hoxd13P70217 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Hoxd13P70217 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Hoxd13P70217 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Hoxd13P70217 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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