Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms