Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms