Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms