Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms