Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dpf3P58269 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms