Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gsc2P56916 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gsc2P56916 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gsc2P56916 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gsc2P56916 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gsc2P56916 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gsc2P56916 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms