Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Cldn18P56857 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Cldn18P56857 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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