Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
CartptP56388 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CartptP56388 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CartptP56388 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CartptP56388 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CartptP56388 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms