Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Rab4aP56371 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Rab4aP56371 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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