Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GferP56213 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GferP56213 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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