Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcanP55066 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcanP55066 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcanP55066 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcanP55066 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcanP55066 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcanP55066 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcanP55066 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcanP55066 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NcanP55066 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcanP55066 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcanP55066 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcanP55066 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcanP55066 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcanP55066 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcanP55066 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcanP55066 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcanP55066 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcanP55066 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms