Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MipP51180 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MipP51180 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MipP51180 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MipP51180 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MipP51180 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MipP51180 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MipP51180 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MipP51180 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MipP51180 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MipP51180 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MipP51180 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MipP51180 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MipP51180 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms