Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FmodP50608 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms