Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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