Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CitP49025 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CitP49025 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
CitP49025 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CitP49025 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CitP49025 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms