Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms