Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms