Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VhlP40338 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
VhlP40338 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
VhlP40338 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
VhlP40338 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
VhlP40338 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
VhlP40338 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
VhlP40338 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
VhlP40338 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
VhlP40338 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
VhlP40338 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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