Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpargP37238 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpargP37238 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpargP37238 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpargP37238 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpargP37238 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpargP37238 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpargP37238 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpargP37238 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpargP37238 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpargP37238 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpargP37238 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpargP37238 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpargP37238 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpargP37238 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpargP37238 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpargP37238 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpargP37238 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PpargP37238 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PpargP37238 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms