Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 693.4 ms