Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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