Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cd28P31041 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cd28P31041 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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