Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprmP28828 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprmP28828 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprmP28828 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprmP28828 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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