Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrgP28705 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms