Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxraP28700 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RxraP28700 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxraP28700 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxraP28700 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxraP28700 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxraP28700 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxraP28700 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxraP28700 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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RxraP28700 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxraP28700 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxraP28700 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxraP28700 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxraP28700 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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RxraP28700 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxraP28700 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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RxraP28700 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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RxraP28700 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxraP28700 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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