Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lef1P27782 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lef1P27782 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms