Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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