Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CftrP26361 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CftrP26361 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CftrP26361 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CftrP26361 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CftrP26361 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CftrP26361 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CftrP26361 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CftrP26361 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CftrP26361 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CftrP26361 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CftrP26361 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CftrP26361 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CftrP26361 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CftrP26361 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CftrP26361 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CftrP26361 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CftrP26361 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CftrP26361 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CftrP26361 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CftrP26361 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CftrP26361 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CftrP26361 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CftrP26361 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CftrP26361 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CftrP26361 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CftrP26361 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CftrP26361 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CftrP26361 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CftrP26361 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CftrP26361 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CftrP26361 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CftrP26361 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CftrP26361 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CftrP26361 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CftrP26361 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CftrP26361 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CftrP26361 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CftrP26361 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CftrP26361 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CftrP26361 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CftrP26361 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CftrP26361 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CftrP26361 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CftrP26361 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CftrP26361 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CftrP26361 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CftrP26361 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CftrP26361 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CftrP26361 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CftrP26361 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CftrP26361 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CftrP26361 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CftrP26361 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CftrP26361 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CftrP26361 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CftrP26361 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CftrP26361 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CftrP26361 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CftrP26361 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CftrP26361 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CftrP26361 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CftrP26361 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CftrP26361 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CftrP26361 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CftrP26361 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CftrP26361 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CftrP26361 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CftrP26361 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CftrP26361 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CftrP26361 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CftrP26361 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CftrP26361 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CftrP26361 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CftrP26361 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CftrP26361 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CftrP26361 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CftrP26361 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CftrP26361 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CftrP26361 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CftrP26361 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CftrP26361 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CftrP26361 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CftrP26361 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CftrP26361 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CftrP26361 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CftrP26361 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CftrP26361 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CftrP26361 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CftrP26361 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CftrP26361 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CftrP26361 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CftrP26361 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CftrP26361 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CftrP26361 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CftrP26361 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CftrP26361 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CftrP26361 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CftrP26361 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CftrP26361 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms