Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms