Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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