Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms