Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Fcer1aP20489 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Fcer1aP20489 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Fcer1aP20489 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
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Fcer1aP20489 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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